Le parc national de Nxai Pan se trouve dans le nord-est du Botswana et se compose de la Nxai Pan, qui fait partie de la plaine salée de Makgadikgadi Pan. Le parc national de Nxai Pan est situé au nord de la route principale Maun-Nata et jouxte le parc national des Makgadikgadi Pans à sa frontière nord. Le pan lui-même s’étend sur environ 40 kilomètres carrés.